Очередное продолжение «Космического линкора Ямато». Во время продолжающейся войны между Империей Галман и Федерацией Болар в Солнце врезается протонная ракета. Ядерный синтез на Солнце ускоряется до небезопасного уровня, и жизнь в Солнечной системе находится под угрозой исчезновения. «Ямато» и его команда должны найти новый дом для человечества, работая в сжатые сроки. Тем временем Земля в предварительном порядке объединилась с Галманами в их войне. Ямато вступает в союз с изгнанной королевой Шалбарта Рудой, которая связана с пацифистскими группировками внутри обоих основных участников войны..