Однажды огромный НЛО вращается над Японией и врезается в сельскую местность за пределами Нагаоки, нарушая обычную жизнь Цубаса Мисудачи. Когда Гатчаманы, легендарные защитники города Тачикава, контролируют весь процесс, из космического корабля появляется мирное инопланетное существо. В последующем хаосе Цубасе дают специальную высокотехнологичную записную книжку, или ПРИМЕЧАНИЕ, от основателя Gatchaman J.J. Робинсон сигнализирует о внезапной вербовке Цубасы в свою группу. Под опекой другого героя Хадзимэ Ичиносе Цубаса медленно начинает приспосабливаться к жизни в качестве защитника справедливости. Между тем технология CROWDS, которая позволяет пользователям проявлять свое сознание в физической форме, распространяется среди общественности, а также одобряется премьер-министром Сугаямой. Тем не менее, таинственная организация, известная как VAPE, приобрела известность благодаря использованию уникальных красных CROWDS, чтобы нанести ущерб, сместив общественное мнение против технологии CROWDS. Гатчаман вместе с новобранцем Цубасой должны прекратить свою разрушительную деятельность, пока не стало слишком поздно.