Действия фантастического мультфильма «Человек-паук: Через вселенные» разворачивается вокруг юноши Майлза Моралеса. Он учится в школе и ведет весьма непримечательный образ жизни, ведь никто из его друзей даже не подозревает о двойной жизни школьника. На самом деле Майлз и есть тот самый Человек-паук, который ведет борьбу с преступным миром. До недавнего времени он считал себя единственным супергероем, пока в результате сбоя не произошло смешение измерений, после чего появились и другие люди со сверхвозможностями. Конечно же, главным человеком-пауком оказывается знакомый всем Питер Паркер. Теперь им предстоит объединиться, чтобы вместе одолеть нового злодея.